Genetic diversity of resistance and sensitive rice genotypes to sogata mechanical damage
Abstract
The Delphacidae family is a group of insects that cause significant damage to cereals. Genetic diversity among six genotypes of rice (Oryza sativa L.), with different behaviors for resistance and susceptibility to mechanical damage from sogata (Tagosodes orizicolus) was studied by molecular SSR microsatellite markers, distributed in the twelve rice chromosomes.151 SSR were used for UPGMA clustering analysis and Dice distance. In the discriminant analysis, three groups were formed with a cophenetic correlation of 0.87, the first constituted by Bluebonnet 50; in the second group were D-Sativa, Cimarron, Venezuela 21 and Zeta 15; and in the last group was Makalioka. Similarity coefficients of the groups were 0.55, 0.74 and 0.66 for each of the clusters. A clear separation was observed in the formation of groups between Makalioka and Bluebonnet 50 as resistant and susceptible genotypes, respectively. Molecular analysis showed a close genetic variability for genotypes. In determining the polymorphism between contrasting parents for mechanical sogata damage, the highest percentage 23.18% was observed between Zeta 15 and Bluebonnet 50 cultivars, followed by Cimarron and Bluebonnet 50 with 20.53%, and the lowest percentage for D-Sativa and Venezuela 21, and Venezuela 21 and Zeta 15, with 12.58% and 4.64%, respectively. These results will be used in the identification and association between SSR and characteristics related to mechanical sogata damage.
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References
• Álvarez R., C. Gamboa, M. Triana, M. Duque y J. Silva. 2000. Mecanismo de resistencia a Tagasodesorizicolus Muir (Homoptera: Delphacidae) de tipo antibiótico y no preferencia en algunas líneas de arroz (Oryza sativa L.). Investigación Agrícola Nº 5:1-12.
• Angulo L., C. Ramis, M. Perdomo e I. Pérez- Almeida. 2006. Estudio de la Base Genética de las variedades de arroz de Venezuela a través de microsatélites. Trabajo presentado en el IX Congreso Latinoamericano de Botánica. Santo Domingo-República Dominicana.
• Arnao E., A. Vegas, Z. Gutiérrez y C. Marín. 2003. Estandarización de la técnica de PCR para la caracterización genética de una población Venezolana de Pyricularia grisea. Fitopatol. Venez. 16:3-7.
• Arnao E., N. Rodríguez, P. Hinrinsen, Y. Jayaro, C. Ramis e I. Pérez-Almeida. 2007. Evaluación de la diversidad genética de subespecies de arroz usando marcadores microsatélites y AFLP. Agronomía Trop. 57(1):45-50.
• Arnao E., Y. Jayaro, P. Hinrinsen, C. Ramis, C. Marín e I. Pérez-Almeida. 2008. Marcadores AFLP en la evaluación de la diversidad genética de variedades y líneas élites de arroz en Venezuela. Interciencia. 33(5):359-364.
• Fondo Latinoamericano de Arroz de Riego (FLAR). 1996. Un método simplificado para cruzamientos en arroz. Manual Técnico. CIAT, Colombia. 35 p.
• Hammer, O., D. A. Harper and P. D. Ryan. 2001. Past Paleontological Statistics Software Package for Education of Data Analysis. Versión 1.42. Paleontología Electrónica. 4:1-9.
• Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas (INIA). 2005. Programa de arroz. Disponible en: www.inia.gob.ve. [Jul. 15, 2005].
• Jennings P. R., W. R. Coffman y H. Kauffman. 1981. Mejoramiento de Arroz. Centro Interna- cional de Agricultura Tropical (CIAT). Colombia. 237 p.
• McCough S., X. Chen, O. Panaud, S. Temnykh, Y. Xu, Y. Cho, N. Huamg, T. Ishii and M. Blair. 1997. Microsattelites marker development, mapping and applications in rice genetics and breeding. Plant Molecular Biology. 35:89-99.
• Pérez-Almeida I., E. Torres, L. Angulo y M. Acevedo. 2011a. Diversidad genética entre cultivares de arroz de Venezuela con base a la estimación del coeficiente de parentesco y análisis con marcadores moleculares micro- satélites (SSR). Interciencia. 36(7):545-551.
• Pérez-Almeida I., L. Angulo, G. Osorio, C. Ramis, A. Bedoya, R. Figueroa-Ruiz, S. Molina Diógenes. 2011b. Método modificado de obtención de ADN genómico en orquídeas (Cattleya spp.) para amplificación con marca- dores moleculares. Bioagro. 23(1):27-34.
• Picca A. M., N. Helguera, A. Salomón y A. Carrera. 2004. Marcadores Moleculares en Biotecnología y Mejoramiento Genético Vegetal. Editores Echenique, V., C. Rubinstein y L. Mogridki. Ediciones INTA. Argentina. 462 p.
• Pieters A., E. Graterol, E. Reyes, R. Álvarez y A. González. 2011. Cincuenta años de mejoramiento de arroz en Venezuela. ¿Que se ha logrado? Interciencia. 36(12):943-948.
• Remes M. 2001. Tagosodes orizicolus (Muir, 1926) vector del virus de la hoja blanca del arroz (HBV) en la República Argentina (Homoptera- Delphacidae). Rev. Fac. Agronomía La Plata. 104(2):151-156.
• Risterucci A., L. Grivet, J. Goran, I. Pieretti, M. Flamet and C. Lanaud. 2000. A high-density likage map of Theobroma cacao L. Theoretical and Applied Genetics. 101:948-955.
• Triana M., I. Lozano, L. Calvert, R. Meneses y C. Martínez. 2004. Marcadores moleculares asociados con la resistencia a Tagosodes orizicolus (Muir). Disponible en línea: http:// www.CIAT.cgiar.org. [Jul. 20, 2005].
• Tohme J. 2010. Las perspectivas desde la genómica hacia la reconstrucción del genoma del arroz. XI Conferencia Internacional del Arroz. CIAT. Cali-Colombia. Resúmenes. 45 p.
• Vivas C. L. y D. Astudillo. 2008. Enfermedades virales transmitidas por la familia Delphacidae con énfasis en el insecto sogata (Tagosodes orizicolus). INIA Hoy. 1:1-19.
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