Diversidad genética de especies de Rubus determinada mediante RAPD
Resumo
La mora de castilla (Rubus glaucus Benth) pertenece a la familia de las Rosáceas y comprende numerosas especies cultivadas y silvestres. En Venezuela se cultiva la especie R. glaucus en los estados Táchira, Mérida, Trujillo, Lara y Aragua. Algunas especies silvestres promisorias crecen cercanas a R. glaucus, entre ellas R. idaeus conocida como frambuesa. La falta de variedades comerciales de mora, así como la preservación de especies silvestres, plantea la necesidad de realizar mejoramiento genético. El objetivo de este trabajo fue la amplificación del ADN mediante marcadores RAPD en especies del género Rubus de los estados Táchira y Aragua, para determinar la diversidad genética. El ADN se extrajo de hojas frescas de R. glaucus, R. idaeus y Rubus spp. Se utilizaron 23 iniciadores RAPD y se seleccionaron OPA10, OPA18, OPW06, OPB09, OPM10, OPK20, que produjeron 44 bandas de las cuales 38 fueron polimórficas. El iniciador OPW06 resultó el más informativo con un PIC de 0,38. Los análisis de agrupamiento y coordenadas principales coincidieron, discriminando la especie R. idaeus del resto de las especies, como también separaron los genotipos del estado Aragua de los del estado Táchira. La similitud entre genotipos en un mismo estado, sugiere la probable influencia del cruce de polen entre especies silvestres y cultivadas, así como el intercambio de material de propagación clonal utilizado por los productores. Estos resultados podrán ser utilizados en programas de conservación de especies y mejoramiento genético que incluyan cruzamientos interespecíficos
Downloads
Referências
• Azofeifa, A. 2006. Uso de marcadores moleculares en plantas; aplicaciones en frutales del trópico. Agronomía Mesoamericana.17(2):221-242.
• Badjakov, I., E. Todorovska, V. Kondakova, R. Boicheva and A. Atanassov. 2006. Assessment the genetic diversity of bulgarian raspberry germplasm collection by Microsatellite and RAPD markers. Journal of Fruit and Ornamental Plant Research. 14(suppl. 1):61-76.
• Bushakra, J., M. Stephens, A. Atmadjaja, K. Lewers, V. Symonds, J. Udall, D. Chagne, E. Buck and S. Gardiner. 2012. Construction of black (Rubus occidentalis) and red (R. idaeus) raspberry linkage maps and their comparison to the genomes of strawberry,apple, and peach. Theoretical and Applied Genetics. 125:311-327.
• Fernández, H., E. Soto, E. Salazar y M. Betancourt. 2010. Análisis RAPD entre y dentro de poblaciones derivadas de girasolsilvestre x cultivado. Agronomía Tropical. 60(3):263-269.
• Gee-Suck, E., Ch. Byung-Yeoup, R. Bandopadhyay, Y. Nam-Hee, Ch. Dong- Geun and Y. Song Joong. 2011. Phylogenic relationships of Rubus species revealed by Randomly Amplified Polymorphic DNA markers. Journal of Crop Science and Biotechnology. 11(1):39-44.
• Graham, J. and R. McNicol. 1995. An examination of the ability of RAPD markers to determine the relationships within and between Rubus species. Theoretical and Applied Genetics. 90:1128-1132.
• Gutiérrez, M., y C. Rincón. 2011. Caracterización de la variabilidad genética mediante el uso de marcadores RAPDs, de un grupo de genotipos nativos y comerciales de caraota en Venezuela. Agronomía Tropical. 61(1):73-83.
• Hammer, Ø., D. Harper and P. Ryan, 2001. PAST: Paleontological Statistics Software Package for Education and Data Analysis. Palaeontologia Electronica. 4(1):9. Available online: https://bit.ly/2TGnRYK [Jul. 20, 2013].
• Han-Wu, Z., W. Xiao-Rong, Z. Bi-Feng, X. Wu- Feng, L. Yuan, and Ch. Qing. 2009. Genetic relationships among 17 bramble cultivars and 11 wild excellent Rubus germplasms from China revealed by RAPD. Agricultural Journal. 4:179-183.
• Harshman, J. 2012. Evaluation of raspberry (Rubus sp.) genotypes for postharvest quality and resistance to Botrytis cinerea. Tesis Masters of Science. University of Maryland. Oregon, USA. 76 p. Available online: https://bit.ly/2wNxZWE. [Ago.08, 2013].
• InfoStat. 2011. InfoStat versión 2.15 Grupo InfoStat. Facultad de Ciencias Agropecuarias (FCA), Universidad Nacional de Córdoba, Argentina.
• Laurentin, H. 2009. Data analysis for characterization of plant genetic resources. Genetic Resources and Crop Evolution. 56:277-292.
• Lee, J., M. Dossett and Ch. Finn. 2012. Rubus fruit phenolic research: The good, the bad, and the confusing. Food Chemistry.
• Marulanda, M. y M. Márquez. 2001. Caracterización de la diversidad genética de Rubus glaucus Benth con marcadores moleculares (RAPD). Actualidades Biológicas. 23(74):57-63.
• Marulanda, M. y M. Márquez. 2002. Evaluación de la estabilidad genética de vitroplantas de Rubus glaucus mediante marcadores moleculares (RAPD). Actualidades Biológicas. 24(76):31-36.
• Marulanda, M., A. López and S. Aguilar. 2007. Genetic diversity of wild and cultivated Rubus species in Colombia using AFLP and SSR markers. Crop Breeding and Applied Biotechnology. 7:242-252.
• Moore, P. and D. Trople. 1999. Crossability of Rubus species with red raspberry in the wsu breeding program. Acta Horticulturae (International Society for Horticultural Science). 505:357-362. Available online: https://bit.ly/2TWpsZb [Jul. 07, 2013].
• Pardo, A., A. Hernández y N. Méndez. 2009. Caracterización molecular de siete clones de ajo (Allium sativum L.) mediante la técnica RAPD. Bioagro. 21(2):81-86.
• Patamsytė, J., D. Zvingila, J. Labokas, V. Baliuckas, L. Balčiūnienė, V. Kleizaitė and V. Rančelis. 2008. Study of genetic diversity in wild raspberry (Rubus idaeus L.) germplasm collection using morphological characters and RAPD markers. Biologija. 54(2):66-74.
• Patamsytë, J., D. Zvingila, V. Maþonytë, V. Kleizaitë, L. Baliucka, V. Balèiûnienë and V. Ranèelis. 2005. Assessement of ecological impact on genetic diversity among populations of Rubus idaeus L. Biologija. 4:24-28.
• Pérez-Almeida, I., S. Vázquez, D. Pérez, y E. Salazar. 2010. Diversidad genética en seis especies de Passiflora spp. utilizando RAPD. Revista de la Facultad de Agronomía de la Universidad del Zulia (LUZ). 27:347- 359.
• Roa, S. 2014. Variabilidad genética en mora (Rubus spp.) presente en los estados Táchira, Mérida y Aragua y su conservación in vitro. Tesis doctoral. Escuela Socialista de Agricultura Tropical (ESAT). Maracay, Venezuela. 103 p.
• Rohlf, F. J. and R. R. Sokal. 1981. Comparing numerical taxonomic studies. Systematic Biology. 30:459-490.
• Roldán-Ruiz, I., E. Dendauw, A. Van Bocktaele, A. Depicke and M. De Loose. 2000. AFLP markers reveal high polymorphic rates in ryegrass (Lolium spp.). Molecular Breeding. 6:125-134.
• Salazar, B., H. Laurentín, M. Dávila and M. Castillo. 2006. Reliability of the RAPD technique for germplasm analysis of sesame (Sesamun indicum L.) from Venezuela. Interciencia. 31(6):456-450.
• Sneath, P. H. A. and R. R Sokal. 1973. Numerical taxonomy: the principles and practice of numerical classification. San Francisco: Freeman. 573 p.
• Stafne, E., J. Clark, C. Matthew, M. Pelto and J. Lindstrom. 2003. Discrimination of Rubus cultivars using RAPD markers and pedigree analysis. Acta Horticulturae (International Society for Horticultural Science). 626:119- 124. Proc. XXVI IHC – Berry Crop Breeding Eds. P. Hicklenton and J. Maas.
Copyright (c) 2014 Sara Roa, Hilda Fernández, Luis Castro, Nora Useche
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License.
