Detección de polimorfismos RAPD en materiales de Musa sp. con respuesta diferencial al ataque de Xanthomonas campestris pv. musacearum

  • Pi-Hsia Chen Universidad Central de Venezuela (UCV), Facultad de Agronomía (FAGRO), Maracay. Venezuela.
  • Efraín Salazar Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas (INIA), Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias (CENIAP), Maracay. Venezuela.
  • Hilda Fernández Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas (INIA), Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias (CENIAP), Maracay. Venezuela.
  • Luis Castro Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas (INIA), Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias (CENIAP), Maracay. Venezuela.
  • Antonio Russo Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas (INIA), Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias (CENIAP), Maracay. Venezuela.
  • Sundry Vázquez Instituto Nacional de Investigaciones Agrícolas (INIA), Centro Nacional de Investigaciones Agropecuarias (CENIAP), Maracay. Venezuela.
Palabras clave: resistencia, Xanthomonas campestris pv. musacearum, RAPD, polimorfismos

Resumen

Para detectar la existencia de polimorfismos RAPD en materiales de Musa sp. con respuesta diferencial a Xanthomonas campestris pv. musacearum, se evaluaron seis genotipos susceptibles (Pisang Awak, Cavendish Enano, Giant Cavendish, FHIA 17 proveniente del campo, FHIA 17 cultivado in vitro, FHIA 25) y dos tolerantes (BB y BBB). Se establecieron las condiciones de aislamiento y amplificación al azar del ADN polimórfico (RAPD). El ADN se aisló, la concentración se midió espectrofotométricamente y la pureza mediante las relaciones A260/A280 y A260/ A230. Se utilizaron 27 iniciadores de Operon Technologies (20 secuencias de la serie OPA, 5 de la OPJ y 2 de la serie OPM). Se realizó un análisis de conglomerado jerárquico usando InfoStat Profesional, el método de agrupamiento de Ward y la distancia de Jaccard. Se obtuvieron patrones de bandas diferenciales para cada genotipo, identificándose seis bandas que distinguen los genotipos tolerantes (981 pb con el primer OPA-03, 630 pb con OPA-07, 630 pb con OPA10, 1725 pb con OPJ01, 580 pb con OPM20 y 630 pb con OPJ05). La serie OPA permitió observar mayores niveles de polimorfismo, con PICs entre 0,22 y 0,68. El análisis de conglomerado separó dos grupos principales, uno incluyó los genotipos con genoma A exclusivamente, y el otro, los genotipos con genoma B, a excepción del FHIA 17 in vitro. Hubo diferencias genéticas entre el FHIA 17 proveniente de campo y el cultivado in vitro.

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.

Citas

• Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT). 1999. Taller integración de fitopatología, mejoramiento y biología molecular para el desarrollo de resistencia al añublo del arroz. Octubre 14-18, Cali, Colombia.
• Damasco, O. P., G. C. Grahan, R. J. Henry, S. W. Adkins, M. K. Smith and I. D. Godwin. 1996. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) detection of dwarf off- types in micropropagated cavendish (Musa sp. AAA) bananas. Plant Cell Reports. 16:118-123.
• Dellaporta, S. J., J. Wood and J. B. Hicks. 1983. A plant DNA minipreparation: version II. Plant Mol. Rep. 1:19-21.
• García, E. y C. Giménez. 1999. El uso de marcadores moleculares en la detección de variantes somaclonales en Musa ssp. Mem. Inst. Biol. Exp. 2:115-118.
• Gubbuk, H., M. Pekmezci, A. N. Omus and M. Erkan. 2004. Identification and selection of superior banana phenotypes in the cultivar Dwarf Cavendish using characteristics and RAPD markers. Pakist. J Bot. 36:331-342.
• Howell, E. C., J. H. Newbury, R. Swennen, L. A. Wilhers and B. V. Ford-Lloyd. 1994. The use of RAPD for identifying and classifying Musa germplasm. Genome 37:328-332.
• Javed, M. A. and R. Y. Othman. 2005. Characterization of Fusarium wilt-resistant and Fusarium wilt- susceptible somaclones of banana cultivar Rastali (Musa AAB) by Random Amplified Polymorphic DNA and Retrotransposon markers. Plant Molec. Biol. Rep. 23:241-249.
• Javed, M. A., M. Chai and R. Y. Othman. 2004. Study of resistance to Fusarium oxysporum using RAPD markers. Biol. Plant. 48:93-99.
• Kaemmer, D., R. Afza, K. Weising, G. Kahl and F. J.Novak. 1992. Oligonucleotide and amplification fingerprinting of wild species and cultivars of banana (Musa spp.) Biotechnology 10:1 030-1 035.
• Lakshmanan, V., S. R. Venkataramareddy and B.Neelwarne. 2007. Molecular analysis of genetic stability in long-term micropropagated shorts of banana using RAPD and ISSR markers. E. J. Biotechnol. 10(1). Disponible en: https://bit.ly/39eJ1lf
• Martin, K. P., S. K. Pachathundikandi, C. L. Zhang, A.Slater and J. Madassery. 2006. RAPD analysis of a variant of banana (Musa sp.) cv. Grande naine and its propagation via shoot tip culture. In vitro Cell. Dev. Biol. Plant. 42:188-192.
• Nadal-Medina, R., G. Manzo-Sánchez, J. Orozco- Romero, M. Orozco-Santos y S. Guzmán-González. 2009. Diversidad genética de bananos y plátanos (Musa spp.) Determinada mediante marcadores RAPD. Revista Fitotecnia Mexicana 32(1):1-7.
• Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO). 2004. FAOSTAT Agricultura. Superficie, producción y rendimiento. Disponible en: https://bit.ly/33IcH96
• Pérez Vicente, L. 2009. Enfermedades exóticas que constituyen una amenaza para la estabilidad de la producción de bananos y plátanos en América Latina y el Caribe. Fitosanidad 13(1):34-35.
• Pillay, N., D. C. Nwakanma and A. Tenkouano. 2000. Identification of RAPD markers to A and B genome sequences in Musa L. Genome 43:763-767.
• Pillay, M., E. Ougundidiwin, D. C. Nwakanma, G. Ude and A. Tenkouano. 2001. Analysis of genetic diversity and relationships in East African banana germoplasm. Theor Appl Genet. 102:965-970.
• Ramaje, C. M., A. M. Borda, S. D. Hamill and M. K. Smith. 2004. A simplified PCR test for early detection of dwarf off-types in micropropagated Cavendish bananas (Musa spp. AAA). Sci. Hort. 103:45-151.
• Ray, T., I. Dutta, P. Saha, S. Das and S. C. Roy. 2006. Genetic stability of three economically important micropropagated banana (Musa spp.) cultivars of lower Indo-Gangetic plains, as assessed by RAPD and ISSR markers. Plant Cell Tiss. Org. Cult. 85:11-21.
• Roldán-Ruiz, I., J. Dendauw, E. Van Bockstaele, A. Depicker and M. De Loose. 2000. AFLP Markers reveal high polymorphic rates in ryegrasses (Lollium spp.). Mol. Breed 6:125-134.
• Salazar, B., H. Laurentín, M. Dávila and M. Castillo. 2006. Reliability of the RAPD technique for germplasm analysis of sesame (Sesamum indicum L.) from Venezuela. Interciencia 31(6):456-460.
• Thu, N. X., L. T. L. Oanh y H. H. Nhi. 2002. Utilización de la técnica RAPD para la identificación y clasificación de algunos cultivares de banano en Vietnam. INFOMUSA 11(1):48-49.
• Tripathi, L., J. N. Tripathi y W. K. Tushemereirwe. 2004. Estrategias para la resistencia a la enfermedad de la marchitez bacteriana de los plátanos a través de la ingeniería genética. African Journal of Biotechnology 3(12):688-692.
• Tripathi, L. and J. N. Tripathi. 2009. Relative suscep- tibility of banana cultivars to Xanthomonas campes- tris pv. musacearum. African Journal of Biotechnology 8(20):5.343-5.350.
• Uma, S., S. A. Siva, M. S. Saraswathi, M. Manicka- vasagam, P. Durai, R. Selvarajan and S. Sathia- moorthy. 2006. Variation and intraspecific relationships in India wild Musabalbisiana (BB) population as evidenced by Random Amplified Polymorphic DNA. Gen. Resour. Crop Evol. 53:349-355.
• Vidal, M. C. and E. García. 2000. Analysis of Musa spp. somaclonal variant resistant to yellow sigatoca. Plant Molec. Biol. Rep. 18:23-31.
• Visser, A. H. 2001. Characterization of banana and plantain using random amplified polymorphic DNA markers. Horticult. Abstr. 72(2):1 154.
• Welsh, J. and M. McClelland. 1990. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acids Res. 18:7 213-7 218.
• Williams, J., A. Kubelik, K. Livak, J. Rafalski and S. Tingey. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nuc. Ac. Res. 18:6 531-6 535.
• Williams, J. G. K., M. K. Hanafey, J. A. Rafalski and S. V. Tingey. 1993. Genetic analysis using random amplified polymorphic DNA markers. Meth. Enzymol 218:704-740.
• Zambrano, A. Y., G. Martínez, Z. Gutiérrez, E.Manzanilla, J. L. Vicente-Villardón y J. Demey. 2007. Marcador RAPD asociado a la resistencia a Fusarium oxysporum en Musa. Interciencia 32(11):775-779.
Publicado
2011-06-30
Cómo citar
Chen, P.-H., Salazar, E., Fernández, H., Castro, L., Russo, A., & Vázquez, S. (2011). Detección de polimorfismos RAPD en materiales de Musa sp. con respuesta diferencial al ataque de Xanthomonas campestris pv. musacearum. Agronomía Tropical, 61(2), 125-132. Recuperado a partir de http://publicaciones.inia.gob.ve/index.php/agronomiatropical/article/view/295
Sección
Artículo original de investigación