Detección de polimorfismos RAPD en materiales de Musa sp. con respuesta diferencial al ataque de Xanthomonas campestris pv. musacearum
Resumo
Para detectar la existencia de polimorfismos RAPD en materiales de Musa sp. con respuesta diferencial a Xanthomonas campestris pv. musacearum, se evaluaron seis genotipos susceptibles (Pisang Awak, Cavendish Enano, Giant Cavendish, FHIA 17 proveniente del campo, FHIA 17 cultivado in vitro, FHIA 25) y dos tolerantes (BB y BBB). Se establecieron las condiciones de aislamiento y amplificación al azar del ADN polimórfico (RAPD). El ADN se aisló, la concentración se midió espectrofotométricamente y la pureza mediante las relaciones A260/A280 y A260/ A230. Se utilizaron 27 iniciadores de Operon Technologies (20 secuencias de la serie OPA, 5 de la OPJ y 2 de la serie OPM). Se realizó un análisis de conglomerado jerárquico usando InfoStat Profesional, el método de agrupamiento de Ward y la distancia de Jaccard. Se obtuvieron patrones de bandas diferenciales para cada genotipo, identificándose seis bandas que distinguen los genotipos tolerantes (981 pb con el primer OPA-03, 630 pb con OPA-07, 630 pb con OPA10, 1725 pb con OPJ01, 580 pb con OPM20 y 630 pb con OPJ05). La serie OPA permitió observar mayores niveles de polimorfismo, con PICs entre 0,22 y 0,68. El análisis de conglomerado separó dos grupos principales, uno incluyó los genotipos con genoma A exclusivamente, y el otro, los genotipos con genoma B, a excepción del FHIA 17 in vitro. Hubo diferencias genéticas entre el FHIA 17 proveniente de campo y el cultivado in vitro.
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Referências
• Centro Internacional de Agricultura Tropical (CIAT). 1999. Taller integración de fitopatología, mejoramiento y biología molecular para el desarrollo de resistencia al añublo del arroz. Octubre 14-18, Cali, Colombia.
• Damasco, O. P., G. C. Grahan, R. J. Henry, S. W. Adkins, M. K. Smith and I. D. Godwin. 1996. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) detection of dwarf off- types in micropropagated cavendish (Musa sp. AAA) bananas. Plant Cell Reports. 16:118-123.
• Dellaporta, S. J., J. Wood and J. B. Hicks. 1983. A plant DNA minipreparation: version II. Plant Mol. Rep. 1:19-21.
• García, E. y C. Giménez. 1999. El uso de marcadores moleculares en la detección de variantes somaclonales en Musa ssp. Mem. Inst. Biol. Exp. 2:115-118.
• Gubbuk, H., M. Pekmezci, A. N. Omus and M. Erkan. 2004. Identification and selection of superior banana phenotypes in the cultivar Dwarf Cavendish using characteristics and RAPD markers. Pakist. J Bot. 36:331-342.
• Howell, E. C., J. H. Newbury, R. Swennen, L. A. Wilhers and B. V. Ford-Lloyd. 1994. The use of RAPD for identifying and classifying Musa germplasm. Genome 37:328-332.
• Javed, M. A. and R. Y. Othman. 2005. Characterization of Fusarium wilt-resistant and Fusarium wilt- susceptible somaclones of banana cultivar Rastali (Musa AAB) by Random Amplified Polymorphic DNA and Retrotransposon markers. Plant Molec. Biol. Rep. 23:241-249.
• Javed, M. A., M. Chai and R. Y. Othman. 2004. Study of resistance to Fusarium oxysporum using RAPD markers. Biol. Plant. 48:93-99.
• Kaemmer, D., R. Afza, K. Weising, G. Kahl and F. J.Novak. 1992. Oligonucleotide and amplification fingerprinting of wild species and cultivars of banana (Musa spp.) Biotechnology 10:1 030-1 035.
• Lakshmanan, V., S. R. Venkataramareddy and B.Neelwarne. 2007. Molecular analysis of genetic stability in long-term micropropagated shorts of banana using RAPD and ISSR markers. E. J. Biotechnol. 10(1). Disponible en: https://bit.ly/39eJ1lf
• Martin, K. P., S. K. Pachathundikandi, C. L. Zhang, A.Slater and J. Madassery. 2006. RAPD analysis of a variant of banana (Musa sp.) cv. Grande naine and its propagation via shoot tip culture. In vitro Cell. Dev. Biol. Plant. 42:188-192.
• Nadal-Medina, R., G. Manzo-Sánchez, J. Orozco- Romero, M. Orozco-Santos y S. Guzmán-González. 2009. Diversidad genética de bananos y plátanos (Musa spp.) Determinada mediante marcadores RAPD. Revista Fitotecnia Mexicana 32(1):1-7.
• Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO). 2004. FAOSTAT Agricultura. Superficie, producción y rendimiento. Disponible en: https://bit.ly/33IcH96
• Pérez Vicente, L. 2009. Enfermedades exóticas que constituyen una amenaza para la estabilidad de la producción de bananos y plátanos en América Latina y el Caribe. Fitosanidad 13(1):34-35.
• Pillay, N., D. C. Nwakanma and A. Tenkouano. 2000. Identification of RAPD markers to A and B genome sequences in Musa L. Genome 43:763-767.
• Pillay, M., E. Ougundidiwin, D. C. Nwakanma, G. Ude and A. Tenkouano. 2001. Analysis of genetic diversity and relationships in East African banana germoplasm. Theor Appl Genet. 102:965-970.
• Ramaje, C. M., A. M. Borda, S. D. Hamill and M. K. Smith. 2004. A simplified PCR test for early detection of dwarf off-types in micropropagated Cavendish bananas (Musa spp. AAA). Sci. Hort. 103:45-151.
• Ray, T., I. Dutta, P. Saha, S. Das and S. C. Roy. 2006. Genetic stability of three economically important micropropagated banana (Musa spp.) cultivars of lower Indo-Gangetic plains, as assessed by RAPD and ISSR markers. Plant Cell Tiss. Org. Cult. 85:11-21.
• Roldán-Ruiz, I., J. Dendauw, E. Van Bockstaele, A. Depicker and M. De Loose. 2000. AFLP Markers reveal high polymorphic rates in ryegrasses (Lollium spp.). Mol. Breed 6:125-134.
• Salazar, B., H. Laurentín, M. Dávila and M. Castillo. 2006. Reliability of the RAPD technique for germplasm analysis of sesame (Sesamum indicum L.) from Venezuela. Interciencia 31(6):456-460.
• Thu, N. X., L. T. L. Oanh y H. H. Nhi. 2002. Utilización de la técnica RAPD para la identificación y clasificación de algunos cultivares de banano en Vietnam. INFOMUSA 11(1):48-49.
• Tripathi, L., J. N. Tripathi y W. K. Tushemereirwe. 2004. Estrategias para la resistencia a la enfermedad de la marchitez bacteriana de los plátanos a través de la ingeniería genética. African Journal of Biotechnology 3(12):688-692.
• Tripathi, L. and J. N. Tripathi. 2009. Relative suscep- tibility of banana cultivars to Xanthomonas campes- tris pv. musacearum. African Journal of Biotechnology 8(20):5.343-5.350.
• Uma, S., S. A. Siva, M. S. Saraswathi, M. Manicka- vasagam, P. Durai, R. Selvarajan and S. Sathia- moorthy. 2006. Variation and intraspecific relationships in India wild Musabalbisiana (BB) population as evidenced by Random Amplified Polymorphic DNA. Gen. Resour. Crop Evol. 53:349-355.
• Vidal, M. C. and E. García. 2000. Analysis of Musa spp. somaclonal variant resistant to yellow sigatoca. Plant Molec. Biol. Rep. 18:23-31.
• Visser, A. H. 2001. Characterization of banana and plantain using random amplified polymorphic DNA markers. Horticult. Abstr. 72(2):1 154.
• Welsh, J. and M. McClelland. 1990. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acids Res. 18:7 213-7 218.
• Williams, J., A. Kubelik, K. Livak, J. Rafalski and S. Tingey. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nuc. Ac. Res. 18:6 531-6 535.
• Williams, J. G. K., M. K. Hanafey, J. A. Rafalski and S. V. Tingey. 1993. Genetic analysis using random amplified polymorphic DNA markers. Meth. Enzymol 218:704-740.
• Zambrano, A. Y., G. Martínez, Z. Gutiérrez, E.Manzanilla, J. L. Vicente-Villardón y J. Demey. 2007. Marcador RAPD asociado a la resistencia a Fusarium oxysporum en Musa. Interciencia 32(11):775-779.
• Damasco, O. P., G. C. Grahan, R. J. Henry, S. W. Adkins, M. K. Smith and I. D. Godwin. 1996. Random amplified polymorphic DNA (RAPD) detection of dwarf off- types in micropropagated cavendish (Musa sp. AAA) bananas. Plant Cell Reports. 16:118-123.
• Dellaporta, S. J., J. Wood and J. B. Hicks. 1983. A plant DNA minipreparation: version II. Plant Mol. Rep. 1:19-21.
• García, E. y C. Giménez. 1999. El uso de marcadores moleculares en la detección de variantes somaclonales en Musa ssp. Mem. Inst. Biol. Exp. 2:115-118.
• Gubbuk, H., M. Pekmezci, A. N. Omus and M. Erkan. 2004. Identification and selection of superior banana phenotypes in the cultivar Dwarf Cavendish using characteristics and RAPD markers. Pakist. J Bot. 36:331-342.
• Howell, E. C., J. H. Newbury, R. Swennen, L. A. Wilhers and B. V. Ford-Lloyd. 1994. The use of RAPD for identifying and classifying Musa germplasm. Genome 37:328-332.
• Javed, M. A. and R. Y. Othman. 2005. Characterization of Fusarium wilt-resistant and Fusarium wilt- susceptible somaclones of banana cultivar Rastali (Musa AAB) by Random Amplified Polymorphic DNA and Retrotransposon markers. Plant Molec. Biol. Rep. 23:241-249.
• Javed, M. A., M. Chai and R. Y. Othman. 2004. Study of resistance to Fusarium oxysporum using RAPD markers. Biol. Plant. 48:93-99.
• Kaemmer, D., R. Afza, K. Weising, G. Kahl and F. J.Novak. 1992. Oligonucleotide and amplification fingerprinting of wild species and cultivars of banana (Musa spp.) Biotechnology 10:1 030-1 035.
• Lakshmanan, V., S. R. Venkataramareddy and B.Neelwarne. 2007. Molecular analysis of genetic stability in long-term micropropagated shorts of banana using RAPD and ISSR markers. E. J. Biotechnol. 10(1). Disponible en: https://bit.ly/39eJ1lf
• Martin, K. P., S. K. Pachathundikandi, C. L. Zhang, A.Slater and J. Madassery. 2006. RAPD analysis of a variant of banana (Musa sp.) cv. Grande naine and its propagation via shoot tip culture. In vitro Cell. Dev. Biol. Plant. 42:188-192.
• Nadal-Medina, R., G. Manzo-Sánchez, J. Orozco- Romero, M. Orozco-Santos y S. Guzmán-González. 2009. Diversidad genética de bananos y plátanos (Musa spp.) Determinada mediante marcadores RAPD. Revista Fitotecnia Mexicana 32(1):1-7.
• Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura (FAO). 2004. FAOSTAT Agricultura. Superficie, producción y rendimiento. Disponible en: https://bit.ly/33IcH96
• Pérez Vicente, L. 2009. Enfermedades exóticas que constituyen una amenaza para la estabilidad de la producción de bananos y plátanos en América Latina y el Caribe. Fitosanidad 13(1):34-35.
• Pillay, N., D. C. Nwakanma and A. Tenkouano. 2000. Identification of RAPD markers to A and B genome sequences in Musa L. Genome 43:763-767.
• Pillay, M., E. Ougundidiwin, D. C. Nwakanma, G. Ude and A. Tenkouano. 2001. Analysis of genetic diversity and relationships in East African banana germoplasm. Theor Appl Genet. 102:965-970.
• Ramaje, C. M., A. M. Borda, S. D. Hamill and M. K. Smith. 2004. A simplified PCR test for early detection of dwarf off-types in micropropagated Cavendish bananas (Musa spp. AAA). Sci. Hort. 103:45-151.
• Ray, T., I. Dutta, P. Saha, S. Das and S. C. Roy. 2006. Genetic stability of three economically important micropropagated banana (Musa spp.) cultivars of lower Indo-Gangetic plains, as assessed by RAPD and ISSR markers. Plant Cell Tiss. Org. Cult. 85:11-21.
• Roldán-Ruiz, I., J. Dendauw, E. Van Bockstaele, A. Depicker and M. De Loose. 2000. AFLP Markers reveal high polymorphic rates in ryegrasses (Lollium spp.). Mol. Breed 6:125-134.
• Salazar, B., H. Laurentín, M. Dávila and M. Castillo. 2006. Reliability of the RAPD technique for germplasm analysis of sesame (Sesamum indicum L.) from Venezuela. Interciencia 31(6):456-460.
• Thu, N. X., L. T. L. Oanh y H. H. Nhi. 2002. Utilización de la técnica RAPD para la identificación y clasificación de algunos cultivares de banano en Vietnam. INFOMUSA 11(1):48-49.
• Tripathi, L., J. N. Tripathi y W. K. Tushemereirwe. 2004. Estrategias para la resistencia a la enfermedad de la marchitez bacteriana de los plátanos a través de la ingeniería genética. African Journal of Biotechnology 3(12):688-692.
• Tripathi, L. and J. N. Tripathi. 2009. Relative suscep- tibility of banana cultivars to Xanthomonas campes- tris pv. musacearum. African Journal of Biotechnology 8(20):5.343-5.350.
• Uma, S., S. A. Siva, M. S. Saraswathi, M. Manicka- vasagam, P. Durai, R. Selvarajan and S. Sathia- moorthy. 2006. Variation and intraspecific relationships in India wild Musabalbisiana (BB) population as evidenced by Random Amplified Polymorphic DNA. Gen. Resour. Crop Evol. 53:349-355.
• Vidal, M. C. and E. García. 2000. Analysis of Musa spp. somaclonal variant resistant to yellow sigatoca. Plant Molec. Biol. Rep. 18:23-31.
• Visser, A. H. 2001. Characterization of banana and plantain using random amplified polymorphic DNA markers. Horticult. Abstr. 72(2):1 154.
• Welsh, J. and M. McClelland. 1990. Fingerprinting genomes using PCR with arbitrary primers. Nucleic Acids Res. 18:7 213-7 218.
• Williams, J., A. Kubelik, K. Livak, J. Rafalski and S. Tingey. 1990. DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers. Nuc. Ac. Res. 18:6 531-6 535.
• Williams, J. G. K., M. K. Hanafey, J. A. Rafalski and S. V. Tingey. 1993. Genetic analysis using random amplified polymorphic DNA markers. Meth. Enzymol 218:704-740.
• Zambrano, A. Y., G. Martínez, Z. Gutiérrez, E.Manzanilla, J. L. Vicente-Villardón y J. Demey. 2007. Marcador RAPD asociado a la resistencia a Fusarium oxysporum en Musa. Interciencia 32(11):775-779.
Publicado
2011-06-30
Como Citar
Chen, P.-H., Salazar, E., Fernández, H., Castro, L., Russo, A., & Vázquez, S. (2011). Detección de polimorfismos RAPD en materiales de Musa sp. con respuesta diferencial al ataque de Xanthomonas campestris pv. musacearum. Agronomía Tropical, 61(2), 125-132. Recuperado de http://publicaciones.inia.gob.ve/index.php/agronomiatropical/article/view/295
Seção
Artigo de pesquisa original
Copyright (c) 2011 Pi-Hsia Chen, Efraín Salazar, Hilda Fernández, Luis Castro, Antonio Russo, Sundry Vázquez
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